阿那格雷的作用机制与烷化剂完全不同，也与羟基脲有所区别，安全性较高。此外，与其他化疗药物针对所有骨髓细胞不同的是，阿那格雷可直接靶向巨核细胞，目前属于治疗血小板增多症的二线药物 。阿那格雷可以选择性作用于巨核细胞系，主要通过影响巨核细胞的成熟来降低血小板数目；同时可抑制环磷腺苷磷酸二酯酶的活性，从而抑制血小板的聚集，减少血栓情况的发生。

骨髓增殖性疾病患者发病和死亡的主要原因是严重的血栓形成及出血，患者常伴随血小板活化及凝血亢进。临床研究表明，阿那格雷治疗各类型的骨髓增殖性疾病，有利于诱导血小板凝血功能恢复正常化，而羟基脲还不能达到这种治疗作用。

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